計算機機房對溫度、濕度及潔凈度均有較嚴格的要求，因此，計算機機房專用空調在設計上與傳統的舒適性空調有著很大區別。傳統的舒適性空調主要是針對于人員設計，送風量小，送風焓差大，降溫和除濕同時進行；而機房內顯熱量占全部熱量的90％以上，它包括設備本身發熱、照明發熱量、通過墻壁、天花、窗戶、地板的導熱量，以及陽光輻射熱，通過縫隙的滲透風和新風熱量等。這些發熱量產生的濕量很小，因此采用舒適性空調勢必造成機房內相對濕度過低，而使設備內部電路元器件表面積累靜電，產生放電損壞設備，干擾數據傳輸和存儲。同時，由于制冷量的（40％～60％）消耗在除濕上，使得實際冷卻設備的冷量減少很多，大大增加了能量的消耗。機房專用空調在設計上采用嚴格控制蒸發器內蒸發壓力，增大送風量使蒸發器表面溫度高于空氣露一點溫度而不除濕，產生的冷量全部用來降溫，提高了工作效率，降低了濕量損失，即由于送風量大，送風焓差減小。

計算機機房對溫度、濕度及潔凈度均有較嚴格的要求，因此，計算機機房專用空調在設計上與傳統的舒適性空調有著很大區別。

舒適性空調風量小，風速低，只能在送風方向局部氣流循環，不能在機房形成整體的氣流循環，機房冷卻不均勻，使得機房內存在區域溫差，送風方向區域溫度低，其他區域溫度高，發熱設備因擺放位置不同而產生局部熱量積累，導致設備過熱損壞。

而機房專用空調送風量大，機房換氣次數高（通常在30～60次／小時），整個機房內能形成整體的氣流循環，使機房內的所有設備均能平均得到冷卻。

機房專用空調一般還配備了專用加濕系統，高效率的除濕系統及電加熱補償系統，通過微處理器，根據各傳感器返饋回來的數據能夠準確的控制機房內的溫度和濕度，而舒適性空調一般不配備加濕系統，只能控制溫度且精度較低，濕度則較難控制，不能滿足機房設備的需要。機房專用空調與舒適型空調在產品設計方面存在顯著差別，二者為不同的目的而設計，無法互換使用。計算機機房內必須使用機房專用空調。